A Confederação do Desporto de Portugal encontra-se representada, a nível nacional, nos seguintes órgãos:
- Conselho Nacional do Desporto (CND) – Daniel Monteiro, Presidente da Confederação do Desporto de Portugal;
- Conselho Consultivo do Instituto Português do Desporto e Juventude, IP (IPDJ, IP) – Daniel Monteiro, Presidente da Confederação do Desporto de Portugal;
- Conselho Consultivo da Autoridade Antidopagem de Portugal (ADOP) – Gonçalo Saldanha, Diretor da Confederação do Desporto de Portugal;
- Conselho Consultivo da Autoridade Para a Prevenção e Combate à Violência no Desporto (APCVD) – Carlos Dias Ferreira, Secretário-geral da Confederação do Desporto de Portugal;
- Conselho de Fundadores e Curadores da Fundação do Desporto – Daniel Monteiro, Presidente da Confederação do Desporto de Portugal;
- Conselho Técnico para o Policiamento dos Espetáculos Desportivos (MAI) – Carlos Dias Ferreira, Secretário-geral da Confederação do Desporto de Portugal;
- Conselho de Arbitragem Desportiva do Tribunal Arbitra do Desporto (TAD) – Luís Paulo Relógio, Presidente do Conselho Jurídico da Confederação do Desporto de Portugal, e Ana Cristina Vital Melo, Vice-presidente da Direção da Confederação do Desporto de Portugal.
- Conselho Nacional do Associativismo Popular (CNAP);
- Confederação Portuguesa de Voluntariado (CPV).